WCS-järjestelmä vastaa järjestelmän ja laitteiston välisestä aikataulutuksesta ja lähettää WMS-järjestelmän antamat komennot kullekin laitteelle koordinoitua toimintaa varten. Laitteen ja WCS-järjestelmän välillä on jatkuva yhteys. Kun laite suorittaa tehtävän, WCS-järjestelmä suorittaa automaattisesti tietojen kirjauksen WMS-järjestelmän kanssa.